119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0226 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  36.59 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  24.81 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  24.31 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 324 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  38.81 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  27.43 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  26.85 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  24.48 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  24.48 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  24.48 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  24.48 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  24.48 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0651  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 235 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 151 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 168 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 155 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  29.33 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  32.58 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 117 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  33.75 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  26.5 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  23.78 
 
 		 269 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.78 
 
 		 261 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  23.78 
 
 		 261 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 261 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>