More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4146 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  100 
 
 		 562 aa  1107    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.69 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  30.16 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.58 
 
 		 511 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.58 
 
 		 511 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  26.05 
 
 		 535 aa  173  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  24.29 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  30.39 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  29.6 
 
 		 711 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.98 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  30.02 
 
 		 708 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.14 
 
 		 501 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  24.08 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.71 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 717 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.26 
 
 		 499 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  26.52 
 
 		 938 aa  127  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.56 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  27.05 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  27.05 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 496 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  24.91 
 
 		 516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.66 
 
 		 502 aa  120  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  27.34 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 510 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  26.36 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.05 
 
 		 740 aa  114  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  27.96 
 
 		 508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  27.26 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  23.64 
 
 		 923 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  26.49 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  27.48 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  27.81 
 
 		 503 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  29.29 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  27.43 
 
 		 513 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  25.95 
 
 		 495 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  26.81 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  22.78 
 
 		 508 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  23.43 
 
 		 514 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  25.54 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  23.42 
 
 		 514 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  23.08 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 554 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 479 aa  97.8  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.62 
 
 		 523 aa  96.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  22.67 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.48 
 
 		 497 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  23.38 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  26.57 
 
 		 507 aa  94.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  27.15 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  26.49 
 
 		 504 aa  91.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 510 aa  90.5  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  21.03 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 501 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  27.76 
 
 		 511 aa  87.8  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  25.63 
 
 		 571 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  25.05 
 
 		 522 aa  87  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.54 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.36 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  23.22 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  21.38 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  25.19 
 
 		 505 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  27.29 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.19 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.51 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.14 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  25 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  24.12 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  25.57 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  21.95 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0906  hypothetical protein  23.98 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396685  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  20.07 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.35 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.97 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  26.6 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.22 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  23.77 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  23.36 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  29.13 
 
 		 475 aa  72  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  22.78 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  25.57 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  21.8 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  27.8 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>