95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3145 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  80.79 
 
 		 879 aa  1364    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  51.45 
 
 		 849 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  73.11 
 
 		 897 aa  1221    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  55.57 
 
 		 845 aa  855    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  79.82 
 
 		 889 aa  1368    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  50.57 
 
 		 850 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  51.79 
 
 		 840 aa  796    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  73.63 
 
 		 887 aa  1239    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  53.64 
 
 		 865 aa  897    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  78.8 
 
 		 889 aa  1368    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  100 
 
 		 878 aa  1765    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  74.49 
 
 		 887 aa  1242    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  73.91 
 
 		 889 aa  1208    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  81.24 
 
 		 884 aa  1377    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  43.73 
 
 		 836 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  43.15 
 
 		 836 aa  631  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  44.77 
 
 		 872 aa  558  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.64 
 
 		 817 aa  313  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  27.78 
 
 		 817 aa  280  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.35 
 
 		 817 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  28.34 
 
 		 836 aa  260  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  28.65 
 
 		 820 aa  244  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.88 
 
 		 825 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  29.98 
 
 		 826 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  27.66 
 
 		 819 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.74 
 
 		 850 aa  212  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 		 803 aa  210  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  29.82 
 
 		 793 aa  207  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 821 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.32 
 
 		 849 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.48 
 
 		 821 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.86 
 
 		 804 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 		 800 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.43 
 
 		 815 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.97 
 
 		 821 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  28.64 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  28.86 
 
 		 820 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.33 
 
 		 802 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.06 
 
 		 813 aa  179  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  27.29 
 
 		 821 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.2 
 
 		 870 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.46 
 
 		 855 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.89 
 
 		 866 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 847 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 		 847 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  31.87 
 
 		 820 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  32.29 
 
 		 819 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  26.52 
 
 		 929 aa  132  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.23 
 
 		 843 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 		 837 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  32.12 
 
 		 819 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  31.78 
 
 		 819 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 845 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.99 
 
 		 858 aa  114  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 846 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  22.91 
 
 		 857 aa  107  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.4 
 
 		 841 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  26.22 
 
 		 843 aa  94  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  20.92 
 
 		 855 aa  88.6  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 		 839 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.7 
 
 		 851 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.08 
 
 		 858 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  25.74 
 
 		 842 aa  84.7  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 		 842 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  26.75 
 
 		 753 aa  83.2  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 842 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  21.68 
 
 		 867 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.77 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  22.34 
 
 		 884 aa  73.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.67 
 
 		 850 aa  72  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  22 
 
 		 855 aa  71.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  22.36 
 
 		 868 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  21.72 
 
 		 846 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  29.53 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  21.72 
 
 		 848 aa  62.4  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  29.53 
 
 		 795 aa  62  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  21.24 
 
 		 844 aa  58.9  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  20.54 
 
 		 857 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.35 
 
 		 855 aa  55.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  21.95 
 
 		 877 aa  55.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  21.33 
 
 		 853 aa  52.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  20.65 
 
 		 841 aa  51.2  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 		 856 aa  50.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  24.54 
 
 		 393 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 877 aa  49.7  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  21.83 
 
 		 866 aa  48.5  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  20.67 
 
 		 847 aa  48.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  19.31 
 
 		 408 aa  47.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 		 809 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 834 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  28.49 
 
 		 787 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  25 
 
 		 373 aa  45.8  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 852 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 445 aa  44.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 		 788 aa  44.3  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>