150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0095 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0095  LemA family protein  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  61.7 
 
 		 188 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  61.7 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  61.7 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  61.7 
 
 		 188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  61.7 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  61.7 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  61.7 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  55.85 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  55.68 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  56.38 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  54.49 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  53.45 
 
 		 189 aa  187  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3606  hypothetical protein  34.66 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  31.25 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3861  hypothetical protein  28.8 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  30.85 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  30.06 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  30.64 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  25.15 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  30.41 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  32.05 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  28.89 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  28.99 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  31.61 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  30.72 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  31.4 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  29.49 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  29.24 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  26.26 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  29.07 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  28.83 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  29.65 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  30.54 
 
 		 433 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  30.56 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  30.77 
 
 		 249 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  27.93 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  30.12 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  30.12 
 
 		 434 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  28.24 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  28.49 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  31.11 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  29.03 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  26.88 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  32.89 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  30.29 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  27.01 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  29.03 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  28.96 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  27.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  26.67 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  31.33 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  27.74 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  28.4 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  30.67 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  27.87 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  27.33 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  31.07 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  27.54 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  26.35 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  26.54 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  30.2 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  29.52 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  26.35 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  26.35 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  29.52 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  27.5 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  31.14 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  31.14 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  28.8 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  27.91 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  25.75 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  29.19 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  28.24 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  24.59 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2848  LemA family protein  27.4 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0119025  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  30.13 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  29.49 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  25.91 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  29.49 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  29.09 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  29.55 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  26.16 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  32.21 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  28.14 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  27.06 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  23.42 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  27.27 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  27.07 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  31.61 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  26.28 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  24.83 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  27.96 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  28.92 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  31.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  27.17 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  27.27 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  26.14 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  26.54 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>