178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3587 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1011 aa  2019    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  36.97 
 
 		 1056 aa  519  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  44.95 
 
 		 1016 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  31.79 
 
 		 1508 aa  233  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.13 
 
 		 1029 aa  231  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.57 
 
 		 919 aa  231  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.02 
 
 		 3954 aa  230  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  30.41 
 
 		 1055 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.04 
 
 		 1227 aa  223  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  31.05 
 
 		 1038 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  31.49 
 
 		 4238 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  31.49 
 
 		 3822 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  31.49 
 
 		 4238 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  29.67 
 
 		 1782 aa  219  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  30.05 
 
 		 983 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  34.72 
 
 		 1550 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  29.17 
 
 		 991 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.48 
 
 		 972 aa  209  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.79 
 
 		 1028 aa  209  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  29.34 
 
 		 995 aa  209  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  35.7 
 
 		 3506 aa  207  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  33.16 
 
 		 1119 aa  207  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  28.6 
 
 		 650 aa  206  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  35.36 
 
 		 1164 aa  202  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  36.6 
 
 		 1004 aa  198  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  35.45 
 
 		 1129 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  35.45 
 
 		 1131 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  36.6 
 
 		 1033 aa  195  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  35.45 
 
 		 1129 aa  196  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  35.45 
 
 		 1131 aa  196  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  35.45 
 
 		 1131 aa  196  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  35.45 
 
 		 1131 aa  196  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  34.38 
 
 		 1001 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 2346 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 2365 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  33.96 
 
 		 986 aa  194  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  33.86 
 
 		 2003 aa  194  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  34.93 
 
 		 1333 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  33.6 
 
 		 1001 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  33.69 
 
 		 995 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.02 
 
 		 2396 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 2371 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  34.92 
 
 		 1131 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.85 
 
 		 677 aa  183  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 2366 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.45 
 
 		 1285 aa  182  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  32.49 
 
 		 985 aa  181  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  32.42 
 
 		 980 aa  180  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  32.54 
 
 		 1130 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  34.51 
 
 		 1006 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  34.68 
 
 		 994 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  31.73 
 
 		 990 aa  174  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  29.5 
 
 		 1519 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.84 
 
 		 1125 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.01 
 
 		 1848 aa  172  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.18 
 
 		 1011 aa  164  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  34.1 
 
 		 488 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1881 aa  158  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  31.38 
 
 		 2711 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 1062 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.76 
 
 		 3629 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  28.7 
 
 		 407 aa  124  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 1053 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  24.49 
 
 		 1152 aa  115  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  26.17 
 
 		 939 aa  92.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.46 
 
 		 774 aa  88.2  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  26.92 
 
 		 972 aa  87  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.48 
 
 		 1489 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  31.27 
 
 		 1012 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  25.85 
 
 		 1025 aa  81.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  28.42 
 
 		 1886 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  23.31 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  25.44 
 
 		 1068 aa  78.6  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  28.87 
 
 		 759 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.02 
 
 		 1769 aa  78.2  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.89 
 
 		 1242 aa  77.4  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.72 
 
 		 913 aa  77.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  29.26 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.5 
 
 		 1369 aa  75.5  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.58 
 
 		 915 aa  74.7  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.05 
 
 		 1177 aa  72.4  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.69 
 
 		 3420 aa  72  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  29.17 
 
 		 942 aa  71.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.37 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.94 
 
 		 926 aa  67  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  33.76 
 
 		 3415 aa  66.6  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.08 
 
 		 1004 aa  66.6  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.4 
 
 		 1134 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  23.73 
 
 		 2407 aa  66.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.05 
 
 		 965 aa  66.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  26.05 
 
 		 909 aa  66.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.44 
 
 		 910 aa  65.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  47.83 
 
 		 542 aa  64.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  21.95 
 
 		 814 aa  64.3  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  25.95 
 
 		 998 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  37.86 
 
 		 145 aa  62.4  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.59 
 
 		 1179 aa  61.6  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  34.75 
 
 		 882 aa  61.6  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3913  outer membrane autotransporter  24.82 
 
 		 1091 aa  58.9  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.29 
 
 		 1322 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>