More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1151 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3428  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.95 
 
 
1076 aa  892  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.26 
 
 
1063 aa  916  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0901  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.53 
 
 
1062 aa  889  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629732  normal  0.563916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3813  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.5 
 
 
1057 aa  841  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353307  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5229  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.68 
 
 
1066 aa  924  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.536808  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4670  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.23 
 
 
1063 aa  813  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3713  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.49 
 
 
1058 aa  827  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.46 
 
 
1057 aa  842  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300706  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4919  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.87 
 
 
1061 aa  928  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462641  normal  0.821842 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6557  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.32 
 
 
1063 aa  813  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169266  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5072  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.29 
 
 
1062 aa  863  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193812  normal  0.0596255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.42 
 
 
1061 aa  909  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0482838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1350  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.99 
 
 
1063 aa  821  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  91.92 
 
 
1040 aa  1933  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.21 
 
 
1062 aa  889  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3044  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.29 
 
 
1075 aa  840  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173145  normal  0.334092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2437  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.42 
 
 
1065 aa  840  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635778  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3092  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.36 
 
 
1056 aa  940  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185291  normal  0.0905875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0479  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.66 
 
 
1064 aa  805  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981936  normal  0.0489217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0648  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.23 
 
 
1089 aa  847  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3305  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44 
 
 
1046 aa  846  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0100  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.54 
 
 
1049 aa  940  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1068  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.55 
 
 
1052 aa  816  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.923485  hitchhiker  0.00533335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1392  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.69 
 
 
1049 aa  842  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5127  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.21 
 
 
1043 aa  937  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5023  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.24 
 
 
1074 aa  856  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4178  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.36 
 
 
1064 aa  823  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3746  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.74 
 
 
1050 aa  805  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.756771  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4224  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.61 
 
 
1068 aa  888  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5850  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.02 
 
 
1043 aa  818  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.645492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4535  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.5 
 
 
1061 aa  911  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736092  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4149  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.65 
 
 
1055 aa  887  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0394  acriflavine resistance protein B  42.83 
 
 
1049 aa  815  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2030  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.35 
 
 
1035 aa  864  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0107983  hitchhiker  0.000143133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5504  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.23 
 
 
1089 aa  847  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.78 
 
 
1061 aa  926  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730926  normal  0.35721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2447  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.79 
 
 
1059 aa  880  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0505  acriflavine resistance protein B  42.83 
 
 
1049 aa  815  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3154  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.83 
 
 
1049 aa  815  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0164  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.29 
 
 
1064 aa  805  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.780381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3324  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.05 
 
 
1052 aa  876  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2193  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.28 
 
 
1044 aa  876  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  100 
 
 
1043 aa  2110  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3700  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.95 
 
 
1033 aa  803  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.34 
 
 
1048 aa  826  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26926  hitchhiker  0.00468273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2284  acriflavin resistance protein  44.75 
 
 
1055 aa  852  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1373  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.81 
 
 
1045 aa  887  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  91.1 
 
 
1038 aa  1913  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1639  multidrug resistance protein MdtF  41.68 
 
 
1041 aa  834  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0267869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3751  acriflavine resistance protein F  43.07 
 
 
1034 aa  806  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0990355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0496  acriflavine resistance protein B  42.83 
 
 
1049 aa  815  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3459  acriflavine resistance protein F  43.16 
 
 
1034 aa  808  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0766453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0538  acriflavine resistance protein B  42.83 
 
 
1049 aa  815  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4353  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.29 
 
 
1053 aa  912  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.27 
 
 
1059 aa  847  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.44 
 
 
1051 aa  804  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5136  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.01 
 
 
1102 aa  897  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.891075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.97 
 
 
1046 aa  813  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194313  normal  0.0197837 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0440  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.07 
 
 
1034 aa  805  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.875483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3208  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.75 
 
 
1050 aa  808  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1382  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.77 
 
 
1043 aa  803  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0739  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.24 
 
 
966 aa  863  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.828108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.23 
 
 
1049 aa  810  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.40035  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1336  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.23 
 
 
1047 aa  843  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1087  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.1 
 
 
1059 aa  914  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5122  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.12 
 
 
1072 aa  863  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2510  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.5 
 
 
1059 aa  880  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307051  normal  0.508426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4508  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.47 
 
 
1069 aa  848  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4359  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.69 
 
 
1064 aa  821  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.04 
 
 
1063 aa  911  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2879  multidrug efflux protein  42.75 
 
 
1050 aa  808  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2796  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.77 
 
 
1085 aa  801  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.174051  normal  0.16394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3931  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.07 
 
 
1057 aa  838  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3374  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.97 
 
 
1061 aa  929  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0514  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.64 
 
 
1069 aa  887  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2886  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.41 
 
 
1065 aa  978  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.418369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4641  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.15 
 
 
1052 aa  887  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463789  normal  0.947312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2174  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.42 
 
 
1052 aa  804  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0040  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.46 
 
 
1055 aa  846  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.513333  normal  0.265897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03075  hypothetical protein  43.07 
 
 
1034 aa  807  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00418  hypothetical protein  42.83 
 
 
1049 aa  815  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4334  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  47.61 
 
 
1068 aa  888  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26619  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3423  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.74 
 
 
1050 aa  806  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3809  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  46.17 
 
 
1056 aa  875  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0639553  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3366  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.73 
 
 
1062 aa  888  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0201859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3352  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  46.78 
 
 
1066 aa  880  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176726  hitchhiker  0.00729316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.48 
 
 
1050 aa  842  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4832  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.42 
 
 
1054 aa  801  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2563  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  46.24 
 
 
1091 aa  894  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44060  multidrug efflux pump HAE1-family transporter protein  42.79 
 
 
1069 aa  859  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.447353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33870  Multidrug efflux RND transporter MexF  46.69 
 
 
1057 aa  897  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1560  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  42.65 
 
 
1040 aa  847  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1969  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.3 
 
 
1056 aa  842  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00020472  normal  0.0816221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2784  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.72 
 
 
1056 aa  825  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155653  normal  0.0401232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3339  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.89 
 
 
1530 aa  802  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2295  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.12 
 
 
1122 aa  846  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2294  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.19 
 
 
1102 aa  856  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1920  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.51 
 
 
1044 aa  834  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0960887  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1621  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.65 
 
 
1048 aa  813  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557587  normal  0.228387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6591  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.53 
 
 
1072 aa  826  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.490488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>