More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3455 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  42.55 
 
 
1049 aa  810    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  40.91 
 
 
1037 aa  803    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  42.24 
 
 
1034 aa  776    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.94 
 
 
1034 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.91 
 
 
1037 aa  803    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  42.55 
 
 
1049 aa  810    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.07 
 
 
1050 aa  787    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3456  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.89 
 
 
1042 aa  791    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.417579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.2 
 
 
1054 aa  788    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  43.31 
 
 
1055 aa  807    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  40.43 
 
 
1049 aa  785    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  41.52 
 
 
1053 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  47.39 
 
 
1052 aa  968    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  43.81 
 
 
1037 aa  890    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  48.31 
 
 
1040 aa  1026    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  53.51 
 
 
1051 aa  1127    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.07 
 
 
1074 aa  832    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.92 
 
 
1044 aa  832    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2592  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.51 
 
 
1047 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.886048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  41.55 
 
 
1063 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.96 
 
 
1044 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  41.85 
 
 
1061 aa  773    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  41.21 
 
 
1050 aa  812    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  39.66 
 
 
1050 aa  776    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  41.21 
 
 
1052 aa  811    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  39.37 
 
 
1050 aa  769    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.68 
 
 
1047 aa  793    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.73 
 
 
1048 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.93 
 
 
1063 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.87 
 
 
1044 aa  785    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.88 
 
 
1040 aa  989    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.42 
 
 
1057 aa  937    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.98 
 
 
1051 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.69 
 
 
1050 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1417  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.28 
 
 
1054 aa  768    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.66 
 
 
1057 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  41.85 
 
 
1061 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.36 
 
 
1059 aa  788    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.59 
 
 
1054 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.63 
 
 
1063 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.09 
 
 
1043 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.9 
 
 
1032 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  40.42 
 
 
1060 aa  773    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  43.15 
 
 
1042 aa  862    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  41.85 
 
 
1066 aa  777    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.5 
 
 
1055 aa  832    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  49.66 
 
 
1034 aa  1031    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.78 
 
 
1057 aa  891    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.56 
 
 
1038 aa  967    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0850  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.13 
 
 
1074 aa  821    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.65 
 
 
1052 aa  772    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  41.76 
 
 
1061 aa  773    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.64 
 
 
1066 aa  765    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0517  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.65 
 
 
1055 aa  777    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.17 
 
 
1053 aa  781    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1190  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.05 
 
 
1057 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0696515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3585  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.59 
 
 
1050 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.68 
 
 
1047 aa  1152    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.02 
 
 
1037 aa  984    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.38 
 
 
1059 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  40.52 
 
 
1069 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1743  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  39.4 
 
 
1084 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134866  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  46.57 
 
 
1076 aa  953    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.18 
 
 
1062 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3780  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.84 
 
 
1054 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0221065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.99 
 
 
1066 aa  1018    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.92 
 
 
1057 aa  823    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0993  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.5 
 
 
1048 aa  821    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40 
 
 
1056 aa  772    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.67 
 
 
1063 aa  940    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.67 
 
 
1050 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  40.04 
 
 
1048 aa  767    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.77 
 
 
1059 aa  782    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.56 
 
 
1055 aa  775    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3420  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.1 
 
 
1042 aa  770    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.85 
 
 
1061 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0738  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.12 
 
 
1055 aa  777    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1940  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.17 
 
 
1055 aa  769    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0454025  hitchhiker  0.00180133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.9 
 
 
1044 aa  830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.07 
 
 
1055 aa  767    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.449144  normal  0.194235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.9 
 
 
1044 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  67.95 
 
 
1058 aa  1422    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.9 
 
 
1051 aa  790    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.56 
 
 
1071 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  41.24 
 
 
1046 aa  815    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  41.83 
 
 
1062 aa  784    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  39.63 
 
 
1045 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  41.73 
 
 
1043 aa  765    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.85 
 
 
1061 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1075  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.21 
 
 
1065 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.64 
 
 
1063 aa  803    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.02 
 
 
1055 aa  806    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.02 
 
 
1052 aa  874    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1993  acriflavin resistance protein  41.88 
 
 
1055 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194422  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.8 
 
 
1044 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0118  transmembrane efflux protein  46.29 
 
 
1048 aa  960    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.02 
 
 
1054 aa  784    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0411  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.66 
 
 
1073 aa  836    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2942  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.92 
 
 
1041 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3554  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.44 
 
 
1046 aa  806    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>