More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0850 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  40.9 
 
 		 1049 aa  763    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.77 
 
 		 1037 aa  782    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.77 
 
 		 1037 aa  782    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.9 
 
 		 1049 aa  763    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.54 
 
 		 1050 aa  779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.55 
 
 		 1059 aa  765    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.97 
 
 		 1054 aa  826    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  43.79 
 
 		 1055 aa  810    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  41.79 
 
 		 1049 aa  794    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  45.78 
 
 		 1052 aa  941    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  43.24 
 
 		 1037 aa  861    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  44.1 
 
 		 1040 aa  886    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  49.95 
 
 		 1051 aa  1020    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  43.74 
 
 		 1074 aa  818    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.01 
 
 		 1044 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  40.24 
 
 		 1063 aa  768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.1 
 
 		 1044 aa  768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  42.82 
 
 		 1061 aa  793    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  40.72 
 
 		 1050 aa  788    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  40.42 
 
 		 1050 aa  751    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  40.25 
 
 		 1052 aa  779    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  40.42 
 
 		 1050 aa  753    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.38 
 
 		 1063 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.71 
 
 		 1044 aa  765    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49 
 
 		 1040 aa  967    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.91 
 
 		 1057 aa  1309    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.27 
 
 		 1051 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.36 
 
 		 1050 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.69 
 
 		 1057 aa  825    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  40.09 
 
 		 1066 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2058  multidrug efflux protein  41.9 
 
 		 1043 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  42.82 
 
 		 1061 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.08 
 
 		 1059 aa  805    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.98 
 
 		 1071 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0746968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.72 
 
 		 1054 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.59 
 
 		 1063 aa  779    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.29 
 
 		 1032 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  42.01 
 
 		 1060 aa  790    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 1042 aa  845    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4768  multidrug efflux protein  41.13 
 
 		 1045 aa  767    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157004  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  43.13 
 
 		 1066 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1194  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  41.72 
 
 		 1047 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000151988  normal  0.324447 
 
 
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.67 
 
 		 1044 aa  785    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.93 
 
 		 1055 aa  790    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  43.57 
 
 		 1034 aa  902    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.66 
 
 		 1057 aa  983    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.16 
 
 		 1038 aa  892    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0850  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  100 
 
 		 1074 aa  2171    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.01 
 
 		 1052 aa  788    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  42.82 
 
 		 1061 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40 
 
 		 1066 aa  750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2444  multidrug efflux protein  41.66 
 
 		 1043 aa  781    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0517  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.77 
 
 		 1055 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.4 
 
 		 1048 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.94 
 
 		 1047 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3303  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.77 
 
 		 1078 aa  755    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.110746  normal  0.948069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3585  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.68 
 
 		 1050 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.05 
 
 		 1047 aa  1011    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1360  multidrug efflux protein  41.01 
 
 		 1037 aa  752    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.17 
 
 		 1037 aa  939    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1793  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.71 
 
 		 1062 aa  769    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.59 
 
 		 1059 aa  756    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  40.99 
 
 		 1069 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0850  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  42.72 
 
 		 1061 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033039  decreased coverage  0.00102824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  66.47 
 
 		 1076 aa  1432    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3602  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.36 
 
 		 1046 aa  751    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.46 
 
 		 1062 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.12 
 
 		 1042 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.38 
 
 		 1066 aa  847    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.08 
 
 		 1057 aa  835    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  62.48 
 
 		 1063 aa  1313    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.79 
 
 		 1050 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  40.82 
 
 		 1048 aa  764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.87 
 
 		 1055 aa  826    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.66 
 
 		 1054 aa  758    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.05 
 
 		 1061 aa  807    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0738  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.56 
 
 		 1055 aa  768    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.98 
 
 		 1044 aa  787    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.98 
 
 		 1044 aa  787    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.67 
 
 		 1058 aa  857    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.35 
 
 		 1051 aa  757    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1521  multidrug efflux protein  41.42 
 
 		 1045 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.03 
 
 		 1071 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  42.06 
 
 		 1046 aa  797    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  40.79 
 
 		 1062 aa  771    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  40.65 
 
 		 1045 aa  791    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.05 
 
 		 1061 aa  807    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1075  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.81 
 
 		 1065 aa  1041    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.09 
 
 		 1063 aa  1061    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.87 
 
 		 1055 aa  837    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.89 
 
 		 1052 aa  881    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.98 
 
 		 1044 aa  785    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0118  transmembrane efflux protein  42.51 
 
 		 1048 aa  856    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.06 
 
 		 1054 aa  758    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0411  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  52.27 
 
 		 1073 aa  1097    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3554  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.23 
 
 		 1046 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.38 
 
 		 1038 aa  845    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3455  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.13 
 
 		 1036 aa  836    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0141  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.19 
 
 		 1047 aa  840    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0498  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.57 
 
 		 1070 aa  795    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249321  normal  0.409358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>