232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  49.03 
 
 		 881 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  50.85 
 
 		 836 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  49.7 
 
 		 871 aa  749    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  50.37 
 
 		 863 aa  765    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  50.87 
 
 		 838 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  50.68 
 
 		 859 aa  753    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  49.09 
 
 		 867 aa  738    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  49.46 
 
 		 899 aa  693    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  50.78 
 
 		 859 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  49.88 
 
 		 857 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  49.56 
 
 		 884 aa  685    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  48.74 
 
 		 842 aa  727    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  50.91 
 
 		 852 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  49.76 
 
 		 841 aa  747    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  50.78 
 
 		 859 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  51.17 
 
 		 859 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  52.2 
 
 		 875 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  55.23 
 
 		 872 aa  843    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  50.66 
 
 		 859 aa  769    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  51.04 
 
 		 859 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  100 
 
 		 811 aa  1611    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  51.02 
 
 		 860 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  51.23 
 
 		 856 aa  777    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  43.5 
 
 		 800 aa  602  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  45.31 
 
 		 779 aa  581  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  43.86 
 
 		 792 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  41.56 
 
 		 820 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 		 826 aa  548  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.29 
 
 		 841 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  59.9 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  42.84 
 
 		 757 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  61.28 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  62.05 
 
 		 944 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  51.44 
 
 		 380 aa  343  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  45.3 
 
 		 392 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.12 
 
 		 741 aa  318  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  47.23 
 
 		 386 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.81 
 
 		 737 aa  311  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.34 
 
 		 737 aa  294  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  51.88 
 
 		 372 aa  290  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  41.3 
 
 		 352 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  41.89 
 
 		 352 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  41.79 
 
 		 352 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.62 
 
 		 329 aa  272  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  40.66 
 
 		 351 aa  269  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  42.94 
 
 		 325 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  43.49 
 
 		 565 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  39.52 
 
 		 380 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.37 
 
 		 331 aa  266  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 		 390 aa  265  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.57 
 
 		 419 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  46.86 
 
 		 387 aa  261  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3629  conserved hypothetical protein; putative SAM domain  53.05 
 
 		 339 aa  252  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.62 
 
 		 389 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  39.12 
 
 		 330 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 327 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  41.05 
 
 		 321 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  41.12 
 
 		 368 aa  237  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.72 
 
 		 393 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  42.2 
 
 		 372 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 419 aa  234  7.000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 435 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 		 418 aa  218  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  33.42 
 
 		 429 aa  217  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  38.46 
 
 		 326 aa  210  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  33.98 
 
 		 376 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.21 
 
 		 453 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  33.45 
 
 		 356 aa  191  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  36.28 
 
 		 366 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 		 362 aa  187  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  34.59 
 
 		 356 aa  184  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 		 367 aa  181  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  32.51 
 
 		 391 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 362 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  32.82 
 
 		 398 aa  179  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  34.19 
 
 		 381 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  31.27 
 
 		 384 aa  177  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  33.02 
 
 		 358 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  29.32 
 
 		 362 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  29.97 
 
 		 359 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.4 
 
 		 382 aa  174  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 364 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  29.64 
 
 		 370 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  32.04 
 
 		 384 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  32.34 
 
 		 384 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  29.59 
 
 		 359 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  32.26 
 
 		 376 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  29.59 
 
 		 359 aa  172  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  33.23 
 
 		 361 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 355 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 365 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 362 aa  167  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 355 aa  162  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  35.24 
 
 		 336 aa  155  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  33.78 
 
 		 386 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  33.23 
 
 		 358 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  30.03 
 
 		 360 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  34.59 
 
 		 340 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  32.04 
 
 		 371 aa  150  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>