202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  100 
 
 		 1047 aa  1994    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  48.23 
 
 		 1046 aa  363  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  28.08 
 
 		 1018 aa  293  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.26 
 
 		 1018 aa  258  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  51.81 
 
 		 1022 aa  251  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  31.28 
 
 		 1024 aa  244  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  50.39 
 
 		 995 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  35.25 
 
 		 881 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  24.7 
 
 		 1039 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  54.44 
 
 		 1291 aa  178  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  28.72 
 
 		 1018 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  26.51 
 
 		 1049 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  44.22 
 
 		 962 aa  164  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  27.37 
 
 		 1029 aa  164  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  29.77 
 
 		 1018 aa  162  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  52.47 
 
 		 1025 aa  160  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.77 
 
 		 1020 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  32.99 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  32.99 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  32.99 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  32.99 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  56 
 
 		 1249 aa  155  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  46.38 
 
 		 989 aa  155  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  32.65 
 
 		 1029 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  41.3 
 
 		 1029 aa  154  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  36.82 
 
 		 1018 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  44.19 
 
 		 986 aa  153  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  32.3 
 
 		 1029 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  44.28 
 
 		 953 aa  152  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  32.16 
 
 		 1018 aa  152  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  43.6 
 
 		 1029 aa  152  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  43.6 
 
 		 1029 aa  152  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  36.82 
 
 		 1018 aa  152  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  45.65 
 
 		 1023 aa  151  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  31.53 
 
 		 1029 aa  151  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  46.51 
 
 		 1081 aa  150  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  45.34 
 
 		 986 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  35.59 
 
 		 1013 aa  149  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  41.53 
 
 		 1009 aa  147  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  41.53 
 
 		 1009 aa  147  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  33.49 
 
 		 1009 aa  145  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.96 
 
 		 1030 aa  144  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  34.39 
 
 		 1020 aa  144  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  35.27 
 
 		 1018 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  35.96 
 
 		 1018 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  35.96 
 
 		 1018 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  52.1 
 
 		 995 aa  140  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  35.25 
 
 		 1018 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  35.42 
 
 		 1018 aa  137  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  33.23 
 
 		 1018 aa  137  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  46.09 
 
 		 1191 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  37.62 
 
 		 1006 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  40.54 
 
 		 1058 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  37.44 
 
 		 1018 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  28.33 
 
 		 1018 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  36.02 
 
 		 1009 aa  133  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  41.74 
 
 		 1020 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  38.94 
 
 		 1017 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  34.38 
 
 		 1038 aa  122  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  31.64 
 
 		 1046 aa  121  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  29.7 
 
 		 1033 aa  119  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  26.88 
 
 		 1085 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  29.82 
 
 		 1303 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.3 
 
 		 1059 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  32.18 
 
 		 1226 aa  110  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22 
 
 		 1108 aa  110  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  37.1 
 
 		 1011 aa  107  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  29.12 
 
 		 1307 aa  107  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  26.76 
 
 		 1088 aa  106  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  35 
 
 		 1114 aa  105  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  38.22 
 
 		 1346 aa  105  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  28 
 
 		 1223 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  28.97 
 
 		 1047 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  29 
 
 		 1091 aa  102  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  28.22 
 
 		 1230 aa  102  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  34.02 
 
 		 1116 aa  102  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  28.97 
 
 		 1048 aa  101  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  28.97 
 
 		 1048 aa  101  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.71 
 
 		 1219 aa  102  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  40 
 
 		 1223 aa  101  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  38.67 
 
 		 1091 aa  101  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  28.97 
 
 		 1047 aa  101  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  28.97 
 
 		 1047 aa  101  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1048 aa  101  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  28.97 
 
 		 1047 aa  101  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  28.97 
 
 		 1047 aa  101  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  40.14 
 
 		 1101 aa  101  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  49 
 
 		 1214 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  33.6 
 
 		 1214 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  33.99 
 
 		 824 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  34.52 
 
 		 810 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  28.5 
 
 		 1047 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  27.23 
 
 		 1227 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  49 
 
 		 1214 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  47.52 
 
 		 1213 aa  99  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  29.44 
 
 		 1046 aa  99  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  31.03 
 
 		 1226 aa  99  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  29.49 
 
 		 1224 aa  98.6  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  29.44 
 
 		 1046 aa  98.2  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.51 
 
 		 1234 aa  97.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>