More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05880 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  100 
 
 
166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  41.21 
 
 
171 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  44.24 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  42.77 
 
 
169 aa  144  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  44.24 
 
 
166 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  40.85 
 
 
169 aa  137  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  35.76 
 
 
166 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  36.36 
 
 
167 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  35.98 
 
 
169 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  37.5 
 
 
173 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  37.8 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  38.1 
 
 
173 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  38.69 
 
 
173 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  36.31 
 
 
173 aa  117  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  40.24 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  40.24 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  39.02 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  37.2 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  37.8 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  37.2 
 
 
176 aa  110  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  36.59 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  33.13 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  39.51 
 
 
169 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  31.52 
 
 
169 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.76 
 
 
197 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  34.52 
 
 
201 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  39.39 
 
 
174 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  37.58 
 
 
170 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.16 
 
 
187 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  38.67 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  40 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.15 
 
 
169 aa  90.5  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.78 
 
 
170 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.55 
 
 
171 aa  89  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  36 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.11 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.32 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.81 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.77 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.12 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.82 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  35.8 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  36.49 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.93 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  37.5 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.69 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  35.57 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  33.88 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  28.99 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.75 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.51 
 
 
584 aa  75.1  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.54 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  35.26 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.89 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.11 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.79 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  33.33 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.8 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.25 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  28.4 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.32 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.97 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.76 
 
 
216 aa  70.9  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.87 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.64 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.95 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.27 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.95 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.71 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  31.72 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.57 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.76 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.56 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.61 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.48 
 
 
204 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.46 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2803  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.82 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.662243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  33.33 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  34.46 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.25 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.33 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.86 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.36 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.72 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.4 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  31.08 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  28.18 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.31 
 
 
217 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.5 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.59 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25.82 
 
 
245 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  28.16 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.69 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.8 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.59 
 
 
217 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.78 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.27 
 
 
227 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.66 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  29.01 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>