More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2430 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  49.85 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  40.18 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  35.17 
 
 		 510 aa  215  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  33.05 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  32.17 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 491 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 423 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 423 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  31.09 
 
 		 487 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  34.59 
 
 		 439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.01 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  32.85 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 		 429 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.87 
 
 		 479 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  30.24 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.03 
 
 		 397 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.99 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.89 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 363 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 358 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  30.47 
 
 		 561 aa  135  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 358 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  27.79 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  28.08 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.69 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.67 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  29.07 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  31.23 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  28.69 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.64 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 382 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.84 
 
 		 407 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.21 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.01 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  29.89 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 389 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 395 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.39 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.09 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  31.14 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>