148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4714 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  100 
 
 		 380 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  55.56 
 
 		 390 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  30.43 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  52.52 
 
 		 595 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  31.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  27.13 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.47 
 
 		 642 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  28.68 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  31.21 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  36.91 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  36.91 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  29.97 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.5 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  37.12 
 
 		 490 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  28.01 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  40 
 
 		 477 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  28.22 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  26.19 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4240  Restriction endonuclease S subunits-like protein  27.61 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  30.08 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  40.94 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1225  hypothetical protein  35.94 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.438073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  39.74 
 
 		 447 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  29.39 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.87 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.06 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  23.67 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  28.97 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  23.13 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  23.97 
 
 		 436 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  35.48 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2976  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.09 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  24.06 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  24.15 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  24.47 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  25.16 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.36 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0162  restriction modification system DNA specificity subunit  28.52 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  26.1 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.85 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  27.88 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  23.49 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1433  restriction modification system DNA specificity subunit  27.11 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  32.72 
 
 		 611 aa  76.6  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  31.87 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  33.14 
 
 		 589 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  31.87 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  31.14 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  30.77 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  29.76 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1131  restriction modification system DNA specificity subunit  25.83 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  31.14 
 
 		 585 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  23.74 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2726  restriction modification system DNA specificity subunit  23.86 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  23.81 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  24.61 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  27.55 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3010  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.43 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116402  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  21.91 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  29.82 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  30.25 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.67 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  22.99 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0901  restriction endonuclease S subunit  24.34 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000124976  hitchhiker  0.000000573897 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  25.77 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  30.63 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  23.55 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.23 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.86 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  31.21 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  23.03 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  29.45 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  31.14 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  25.43 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  26.52 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  23.03 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  30.72 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  22.84 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  20.81 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1001  hypothetical protein  28.99 
 
 		 196 aa  56.2  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02856  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  25.3 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  28.47 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  26.35 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  29.45 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  22.01 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  25.35 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.6 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  26.43 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.97 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  26.43 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  26.82 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  27.62 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.87 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  21.78 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.5 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  23.46 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1311  restriction modification system DNA specificity subunit  24.18 
 
 		 578 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>