24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1001 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1001  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0998  type I restriction-modification system specificty subunit  57.46 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  30.12 
 
 		 629 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  31.16 
 
 		 634 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  27.85 
 
 		 621 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  27.96 
 
 		 613 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  28.99 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  31.58 
 
 		 730 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  27.81 
 
 		 556 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 		 1362 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0787  hypothetical protein  31.52 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  25 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0839  hypothetical protein  26.72 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.48 
 
 		 390 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1886  hypothetical protein  23.35 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0912016  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5291  hypothetical protein  19.89 
 
 		 555 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.673527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  27.27 
 
 		 454 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.74 
 
 		 390 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  21.6 
 
 		 451 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.49 
 
 		 419 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  28.67 
 
 		 417 aa  42.4  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  24.14 
 
 		 557 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.61 
 
 		 462 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  23.48 
 
 		 561 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>