51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5291 on replicon NC_011882
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011882  Cyan7425_5291  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1146    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.673527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  26.14 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  28.27 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  39.09 
 
 		 612 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20390  hypothetical protein  22.5 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.123185  normal  0.078354 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  36.88 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  31.35 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  29.38 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  38.14 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  38.14 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.37 
 
 		 495 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  31.29 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  22.89 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.08 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  29.34 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  42.86 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  25.15 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  25.97 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.17 
 
 		 419 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.17 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  34.74 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  33 
 
 		 443 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  35.4 
 
 		 422 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  28.72 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0323  hypothetical protein  22.09 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.64 
 
 		 400 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  23.23 
 
 		 405 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  28.28 
 
 		 464 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1460  type I restriction-modification system, S subunit, putative  25 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  27.22 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  37.78 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  37.78 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  25.28 
 
 		 425 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  25.82 
 
 		 587 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  31.82 
 
 		 420 aa  47  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  22.6 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.91 
 
 		 419 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 		 1362 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.91 
 
 		 419 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1148  hypothetical protein  28.09 
 
 		 427 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00179115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  27.06 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0613  hypothetical protein  24.32 
 
 		 191 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.37 
 
 		 456 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  31.09 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  21.28 
 
 		 446 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1001  hypothetical protein  19.89 
 
 		 196 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02856  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  22.12 
 
 		 375 aa  44.7  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0545  hypothetical protein  25.47 
 
 		 701 aa  44.3  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0614  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.95 
 
 		 401 aa  43.9  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.56 
 
 		 462 aa  43.5  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>