12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1460 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1460  type I restriction-modification system, S subunit, putative  100 
 
 		 446 aa  922    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0323  hypothetical protein  29.32 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20390  hypothetical protein  27.49 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.123185  normal  0.078354 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  19.94 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0920  hypothetical protein  20.79 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0545  hypothetical protein  21.01 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  20 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0941  restriction modification system DNA specificity subunit  27.41 
 
 		 195 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.172748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 1362 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  26.85 
 
 		 730 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5291  hypothetical protein  25 
 
 		 555 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.673527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  23.66 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>