31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0941 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0941  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.172748  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0991  restriction modification system DNA specificity subunit  74.87 
 
 		 195 aa  302  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.603611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0613  hypothetical protein  35.08 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1886  hypothetical protein  26.04 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0912016  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  29.32 
 
 		 730 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2552  hypothetical protein  23.37 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.814939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.4 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  23.04 
 
 		 634 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2349  hypothetical protein  25.53 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58537  hitchhiker  0.00897882 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0200  hypothetical protein  25.73 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.580499  hitchhiker  0.000493994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4263  hypothetical protein  25.74 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1460  type I restriction-modification system, S subunit, putative  27.41 
 
 		 446 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  31.07 
 
 		 621 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  29.6 
 
 		 429 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  29.41 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  29.03 
 
 		 400 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 629 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2496  subunit S of type I restriction-modification system  23.84 
 
 		 565 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00268922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  27.54 
 
 		 461 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  31.58 
 
 		 476 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.76 
 
 		 401 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 400 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.32 
 
 		 386 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  27 
 
 		 392 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  32.34 
 
 		 375 aa  42.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  26.32 
 
 		 456 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  30.84 
 
 		 514 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  25 
 
 		 435 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0412  restriction modification system DNA specificity subunit  21.76 
 
 		 588 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  29.01 
 
 		 401 aa  42  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  29.91 
 
 		 613 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>