189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0839 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  100 
 
 		 613 aa  1251    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  29.58 
 
 		 634 aa  203  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 621 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 629 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.97 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.14 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.22 
 
 		 499 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  28.33 
 
 		 523 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  27.76 
 
 		 515 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  29.9 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  24.65 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  24.59 
 
 		 809 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  25.3 
 
 		 505 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 522 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  24.7 
 
 		 799 aa  92  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.57 
 
 		 516 aa  90.9  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  24.68 
 
 		 574 aa  90.9  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  24.68 
 
 		 585 aa  90.5  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.27 
 
 		 504 aa  90.5  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.71 
 
 		 498 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  29.03 
 
 		 496 aa  90.5  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  29.41 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.25 
 
 		 587 aa  90.1  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.05 
 
 		 860 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  24.24 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  25.21 
 
 		 810 aa  89.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  25.38 
 
 		 633 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  23.81 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.71 
 
 		 500 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2366  N-6 DNA methylase  25.18 
 
 		 600 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 517 aa  87.8  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  22.59 
 
 		 494 aa  87.8  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 527 aa  87.4  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 498 aa  87  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  24.82 
 
 		 1362 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  22.94 
 
 		 574 aa  84.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  24.33 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  24.19 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  27.35 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  24 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  23.58 
 
 		 814 aa  82.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.06 
 
 		 808 aa  81.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  26.37 
 
 		 810 aa  81.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  24.6 
 
 		 527 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  24.19 
 
 		 506 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.94 
 
 		 568 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  22.8 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  24.68 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  22.55 
 
 		 814 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  24.9 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.81 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  27.16 
 
 		 908 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.64 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  26.94 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  24.47 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.75 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  24.21 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  22.75 
 
 		 871 aa  74.3  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  24.88 
 
 		 808 aa  74.3  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  23.35 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  26.76 
 
 		 856 aa  73.9  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  23.28 
 
 		 489 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  20.6 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  24.46 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.31 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  23.01 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  20.6 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  26.72 
 
 		 863 aa  71.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  25.12 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  25.43 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  23.81 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  22.88 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  24.39 
 
 		 827 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 		 547 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  20.94 
 
 		 505 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  25.35 
 
 		 584 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  25.59 
 
 		 853 aa  70.1  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  20.78 
 
 		 847 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  22.75 
 
 		 814 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  27.32 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  22.59 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.18 
 
 		 708 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  25.51 
 
 		 863 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  21.78 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  25.12 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  27.62 
 
 		 863 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  20.79 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  25.91 
 
 		 910 aa  67  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  24.39 
 
 		 862 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 824 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>