181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2366 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2366  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 600 aa  1219    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0412  restriction modification system DNA specificity subunit  27.22 
 
 		 588 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  24.83 
 
 		 634 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  26.67 
 
 		 515 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  25.65 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  24.39 
 
 		 621 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.18 
 
 		 613 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 515 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  26.54 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  26.3 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  31.07 
 
 		 517 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  26.28 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  29.56 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  26.67 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  26.67 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  25.18 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  25.32 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  26.19 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  25.37 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.4 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  30.51 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  28.14 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  26.98 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  28.92 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  25.24 
 
 		 871 aa  74.3  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  24.43 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  28.29 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  27.7 
 
 		 809 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.3 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  26.27 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  24.84 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  28.8 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  27.04 
 
 		 847 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  29.06 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  28.91 
 
 		 585 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.31 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  28.86 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1218  N-6 DNA methylase  30.04 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  24.62 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  24.62 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  27.05 
 
 		 827 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 		 518 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  24.31 
 
 		 518 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  19.96 
 
 		 1362 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  27.22 
 
 		 524 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.14 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  23 
 
 		 527 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.41 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.45 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  24.88 
 
 		 814 aa  67  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.89 
 
 		 855 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 775 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.87 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  27.62 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  24.38 
 
 		 908 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0548  N-6 DNA methylase  28.86 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  26.63 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  26.75 
 
 		 862 aa  65.1  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  24.88 
 
 		 873 aa  65.1  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  27.22 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  33.99 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  32.26 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  26.6 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.32 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  26.04 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0636  N-6 DNA methylase  31.1 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  29.83 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  27.52 
 
 		 856 aa  63.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  31.65 
 
 		 513 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  26.29 
 
 		 910 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  27.65 
 
 		 535 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3524  N-6 DNA methylase  29.25 
 
 		 549 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  24.37 
 
 		 824 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  26.29 
 
 		 863 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  26.97 
 
 		 863 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  27.22 
 
 		 525 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25.98 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  27 
 
 		 808 aa  61.6  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  25.44 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  31.68 
 
 		 570 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  30.45 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  23.47 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  27.22 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  26.8 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  23.9 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  23.03 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  22.43 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  26.25 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  25.32 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  25.32 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  26.67 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  28.93 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  21.27 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  22.9 
 
 		 822 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  24.44 
 
 		 874 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  28.38 
 
 		 537 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>