111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0412 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0412  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 588 aa  1203    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2366  N-6 DNA methylase  27.22 
 
 		 600 aa  126  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  33.97 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  29.81 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  31.64 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  34.97 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  30.19 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  34.15 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  33.6 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  35.38 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  22.59 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.58 
 
 		 462 aa  63.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  31.33 
 
 		 862 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  28.21 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  33.09 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  33.11 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  30.14 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  21.61 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  22.99 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  32.5 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  32.54 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.3 
 
 		 504 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  26.58 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.67 
 
 		 855 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 518 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 518 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  30.87 
 
 		 517 aa  55.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  30.07 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  31.67 
 
 		 540 aa  55.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  24.47 
 
 		 809 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  27.89 
 
 		 853 aa  54.7  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1159  N-6 DNA methylase  32.57 
 
 		 238 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  34.12 
 
 		 847 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 574 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  27.78 
 
 		 856 aa  54.3  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  27.61 
 
 		 515 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.17 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  24.66 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.94 
 
 		 587 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  25.68 
 
 		 871 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  27.07 
 
 		 556 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  27.85 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  29.58 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  30.83 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  30.33 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  30.33 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  24.48 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  25.99 
 
 		 808 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  29.61 
 
 		 525 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  30.83 
 
 		 535 aa  52  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  32.5 
 
 		 534 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.6 
 
 		 574 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  26.56 
 
 		 863 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  26.99 
 
 		 523 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  31.4 
 
 		 584 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  25.9 
 
 		 523 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  29.23 
 
 		 544 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  23.64 
 
 		 495 aa  51.2  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  28.77 
 
 		 523 aa  50.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.03 
 
 		 504 aa  50.4  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  26.06 
 
 		 827 aa  50.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 522 aa  50.4  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  25.66 
 
 		 815 aa  50.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 508 aa  50.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  25.25 
 
 		 874 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 523 aa  50.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  27.01 
 
 		 799 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  25.66 
 
 		 814 aa  50.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  21.47 
 
 		 1362 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 810 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  35.14 
 
 		 814 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  30.14 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  23.32 
 
 		 775 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  26.88 
 
 		 505 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  30.17 
 
 		 526 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  28.8 
 
 		 585 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  29.86 
 
 		 505 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  26.81 
 
 		 799 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  26.29 
 
 		 513 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  26.83 
 
 		 413 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.05 
 
 		 574 aa  47.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  28.34 
 
 		 513 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  26.32 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  33.78 
 
 		 873 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.67 
 
 		 456 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  28.72 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  30.39 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  26.57 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  26.57 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  24.38 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  28.08 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0973  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.32 
 
 		 228 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>