64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1886 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1886  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0912016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2552  hypothetical protein  45.99 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.814939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2349  hypothetical protein  41.92 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58537  hitchhiker  0.00897882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0162  hypothetical protein  26.7 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0941  restriction modification system DNA specificity subunit  26.04 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.172748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0839  type I restriction-modification system, M subunit, putative  29.67 
 
 		 613 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  26.88 
 
 		 775 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.11 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  31.2 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 1362 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.68 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 629 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  24.04 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0613  hypothetical protein  21.81 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.37 
 
 		 439 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 		 634 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1500  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.16 
 
 		 398 aa  51.2  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.100633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  26.73 
 
 		 479 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  27.64 
 
 		 393 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  27.16 
 
 		 419 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  27.16 
 
 		 419 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.79 
 
 		 401 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 		 399 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0991  restriction modification system DNA specificity subunit  22.22 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.603611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.17 
 
 		 390 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.3 
 
 		 495 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  27.42 
 
 		 419 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.69 
 
 		 415 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  28.57 
 
 		 444 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  29.91 
 
 		 404 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  27.81 
 
 		 411 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.39 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  29.37 
 
 		 556 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  24.1 
 
 		 453 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1001  hypothetical protein  23.35 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  27.87 
 
 		 405 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  25.49 
 
 		 453 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.1 
 
 		 390 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0839  hypothetical protein  30.97 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0787  hypothetical protein  30.97 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  31.88 
 
 		 589 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  23.33 
 
 		 391 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  28.03 
 
 		 446 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  29.17 
 
 		 425 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.16 
 
 		 428 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  28.3 
 
 		 415 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  31.98 
 
 		 561 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  23.4 
 
 		 461 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  25 
 
 		 477 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.45 
 
 		 384 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  28.48 
 
 		 590 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  20.47 
 
 		 453 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  26.19 
 
 		 390 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  21.47 
 
 		 402 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  31.96 
 
 		 420 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.05 
 
 		 456 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.22 
 
 		 412 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 482 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.91 
 
 		 442 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0158  metallophosphoesterase  34.21 
 
 		 431 aa  42  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000210042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  28.42 
 
 		 401 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.99 
 
 		 400 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  24.43 
 
 		 415 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  23.35 
 
 		 477 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>