148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3869 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  94.95 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  55.76 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  50.7 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  49.77 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  69.47 
 
 		 133 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  46.63 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  46.63 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  44.71 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  41.82 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  41.82 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  39.9 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  37.9 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  37.09 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  38.36 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  36.57 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  36 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  33 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  46.15 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  34.55 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  36.32 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  33.96 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  35.42 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  37.25 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  42.47 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.82 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  33.68 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.3 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.41 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  30.8 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.33 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  35.34 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  35.98 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  27.23 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  25.13 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  27.06 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  24.62 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  27.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  28.1 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  32.88 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.62 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.93 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  27.63 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  29.38 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  28.27 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  33.62 
 
 		 153 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.76 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  27.96 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  29.61 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.73 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.06 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  29.61 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  35.9 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  36.36 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  29.63 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  31.21 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  31.75 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.6 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.6 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.6 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  31.65 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  29.71 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  34.41 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  29.51 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  28.99 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  35.06 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  30.3 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  36.17 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  31.21 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  29.45 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  32.48 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  27.59 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  29.27 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  30.3 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.11 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  32.99 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  27.31 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  24.11 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0891  peptidase S24 and S26 domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.352562  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5036  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.35 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  29.77 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  40 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5442  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.989966  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>