More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0909 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.22 
 
 
248 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 
259 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 
249 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
244 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
253 aa  235  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
248 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
252 aa  222  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
251 aa  221  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
253 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  50.62 
 
 
260 aa  215  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
251 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
260 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
261 aa  208  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  44.75 
 
 
257 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
250 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
250 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
250 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
264 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
274 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
254 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
260 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
250 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
250 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 
248 aa  198  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
252 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
252 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
249 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.02 
 
 
258 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
254 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
245 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
245 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
254 aa  188  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
246 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 
259 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
255 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
252 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  42.63 
 
 
254 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
258 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
255 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
255 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 
249 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.83 
 
 
288 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  43.5 
 
 
243 aa  177  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
269 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
259 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.08 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
251 aa  171  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
260 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
267 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  39.77 
 
 
282 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  39.29 
 
 
259 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  40.46 
 
 
264 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
282 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
282 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
256 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.13 
 
 
257 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1472  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  41.6 
 
 
282 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0273044  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
245 aa  168  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
259 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
263 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.25 
 
 
262 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.92 
 
 
273 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
251 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
246 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
252 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
262 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
254 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
248 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
246 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
253 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
255 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.87 
 
 
250 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>