243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2521 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  50.87 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  44.94 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  45.56 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  42.94 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  42.46 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  40.66 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  37.37 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  42.13 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  39.67 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  33.33 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  32.93 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  37.24 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.34 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  38.33 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 183 aa  97.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 197 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  34.76 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  32.77 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.03 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 195 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  31.14 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  35.03 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  30.95 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  31.14 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  31.14 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  35.08 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  28.65 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  34.21 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  34.02 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  30.22 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.36 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  31.64 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  33.71 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  36.7 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  36.87 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  37.31 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  34.55 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.47 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  35.91 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  35.6 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  36.11 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  34.05 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  34.85 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  35.79 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  36.07 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  34.74 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  35.36 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  36.05 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  36.05 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.81 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  28.19 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  35.06 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  35.06 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  36.7 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  34.97 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.02 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25.57 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>