234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3721 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  70.93 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  64.78 
 
 		 244 aa  290  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  61.16 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  49.3 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  48.83 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  44.29 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  45.02 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  44.91 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  44.91 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  43.46 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  42.78 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  39.72 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 251 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  39.65 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  38.1 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 662 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 320 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  41.11 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  33.18 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  36.67 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  35.05 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  38.5 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  37.17 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1413  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  38.78 
 
 		 244 aa  94.7  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  37.96 
 
 		 137 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  34.55 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  31.92 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06576  hypothetical protein  27.63 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>