More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0802 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  326  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 141 aa  94  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 182 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  34.35 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  30.28 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  27.21 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.46 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.46 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.46 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.46 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  28.19 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.94 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.46 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>