More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3749 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  756    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  88.83 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  83.46 
 
 		 408 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  78.72 
 
 		 390 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  73.01 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  64.85 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  62.87 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  56.51 
 
 		 417 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  63.41 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  61.14 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  61.14 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  61.14 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  61.14 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  61.14 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  60.87 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  61.14 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  58.27 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  57.45 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  59.85 
 
 		 407 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  60.89 
 
 		 403 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  59.08 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  59.08 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  59.74 
 
 		 399 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  60.94 
 
 		 408 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 400 aa  336  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  52.42 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  55.41 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  53.33 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  48.7 
 
 		 399 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  57.01 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 410 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  56.23 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  55.7 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  45.3 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  46.99 
 
 		 447 aa  245  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  37.7 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.86 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  29.69 
 
 		 451 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  29.69 
 
 		 451 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  29.69 
 
 		 451 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  29.41 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  29.69 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  32.95 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.19 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  28.8 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  28.12 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  33.58 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  28.99 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  29.7 
 
 		 407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  29.69 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  29.28 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  30.32 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  27.85 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  29.85 
 
 		 407 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 403 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  31.12 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  27.07 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  30.67 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.3 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.33 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 391 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  28.73 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>