241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13994 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  100 
 
 
336 aa  691    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 
353 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  33.57 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 
283 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  36.8 
 
 
327 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  33.07 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  31.44 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 
315 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  28.79 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
305 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 
298 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
319 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  33.85 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 
308 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 
351 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 
323 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
308 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  30.68 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  31.98 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  28.75 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 
319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  32.81 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
365 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 
333 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  33.85 
 
 
316 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
306 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
317 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
312 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
311 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 
312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
305 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  27.52 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  30.89 
 
 
305 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 
426 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  29.53 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 
318 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 
318 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 
323 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 
308 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.77 
 
 
327 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  31.66 
 
 
314 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 
310 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  25.29 
 
 
393 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  25.65 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  24.89 
 
 
422 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  26.59 
 
 
302 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  25.63 
 
 
372 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  23.84 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  26.28 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  29.49 
 
 
474 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 
289 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 
292 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 
295 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 
295 aa  56.2  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  28.51 
 
 
459 aa  56.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  22.71 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  25.82 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  25.63 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  25.38 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.74 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.74 
 
 
297 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  21.05 
 
 
392 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  25.74 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.74 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  25.74 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  21.48 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 
401 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25.74 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25.93 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  26.95 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>