More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11922 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  100 
 
 		 338 aa  698    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  52.99 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  45.25 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  47.76 
 
 		 322 aa  288  8e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  45.93 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  40.97 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  38.46 
 
 		 315 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  39.74 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  38.29 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  39.87 
 
 		 329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  39.42 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  39.42 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  39.41 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  39.74 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  38.91 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  38.24 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  38.11 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  40.26 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  38.46 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  38.8 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  41.5 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  40.84 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  38.85 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  38.53 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  38.14 
 
 		 326 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  45.32 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  38.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  37.01 
 
 		 341 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  37.54 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  36.28 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  37.91 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  38.98 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  38.51 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  37.13 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  43.17 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  36.72 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  41.09 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  40 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  40.73 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  40 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  36.67 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  42.32 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  45.87 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  42.31 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  37.54 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  38.65 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  49.64 
 
 		 940 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  30.1 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  33.91 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  34.48 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  26.44 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  28.86 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  32.02 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  31.62 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  29.15 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  30.65 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  27.98 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  27.68 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  31.56 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  30.49 
 
 		 483 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  30.65 
 
 		 418 aa  99.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  27.6 
 
 		 355 aa  99.4  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.15 
 
 		 565 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.15 
 
 		 565 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.34 
 
 		 462 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  30.56 
 
 		 443 aa  96.3  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.08 
 
 		 575 aa  95.1  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.65 
 
 		 589 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0492  putative DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.02 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.19 
 
 		 550 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.18 
 
 		 732 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.31 
 
 		 496 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.65 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26.57 
 
 		 526 aa  94  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.41 
 
 		 518 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.95 
 
 		 606 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  30.22 
 
 		 559 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  30.18 
 
 		 642 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 		 627 aa  92.4  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.22 
 
 		 562 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  31.71 
 
 		 476 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  31.22 
 
 		 413 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.6 
 
 		 478 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  27.08 
 
 		 650 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.6 
 
 		 478 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.76 
 
 		 735 aa  90.1  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.92 
 
 		 588 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.46 
 
 		 589 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.43 
 
 		 570 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  27.24 
 
 		 625 aa  89.4  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 540 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  30.91 
 
 		 807 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 447 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  31.11 
 
 		 454 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.73 
 
 		 562 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.73 
 
 		 562 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.73 
 
 		 562 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.82 
 
 		 663 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.56 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.59 
 
 		 601 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>