More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2899 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  70.37 
 
 
270 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  70.37 
 
 
270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  62.83 
 
 
269 aa  351  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  60.82 
 
 
266 aa  334  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  54.81 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  52.42 
 
 
255 aa  278  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01941  Tfp pilus assembly protein PilF  46.26 
 
 
270 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  42.38 
 
 
256 aa  201  7e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0119  hypothetical protein  42.38 
 
 
254 aa  202  7e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000942476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  46.29 
 
 
262 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  46.29 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  41.28 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  40.35 
 
 
270 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  41.67 
 
 
262 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1707  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
262 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18031  hypothetical protein  40 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.26 
 
 
810 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 
878 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 
632 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35856  predicted protein  31.94 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142385  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36370  predicted protein  37.06 
 
 
213 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.08989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.86 
 
 
1022 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
649 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39123  predicted protein  35.16 
 
 
196 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 
626 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  38.78 
 
 
462 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.46 
 
 
1056 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  37.59 
 
 
539 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
927 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
352 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 
406 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 
406 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 
626 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
635 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
635 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
614 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
614 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
617 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 
637 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 
612 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
636 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  34.9 
 
 
706 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 
611 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.8 
 
 
622 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 
1056 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
685 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 
639 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  35.9 
 
 
582 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
614 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.11 
 
 
818 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.89 
 
 
626 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.89 
 
 
614 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.89 
 
 
614 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.53 
 
 
988 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
784 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
847 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
361 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 
3560 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.77 
 
 
725 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
718 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
292 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 
681 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30.53 
 
 
706 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
637 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
620 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
4489 aa  92.8  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 
425 aa  92.4  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
217 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
612 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.38 
 
 
764 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.05 
 
 
219 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.75 
 
 
560 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1631  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.0840181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
388 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
388 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
515 aa  89.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.46 
 
 
778 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
297 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
306 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
909 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  36.57 
 
 
573 aa  89  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.41 
 
 
620 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  33 
 
 
864 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
3035 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.02 
 
 
373 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  36.43 
 
 
581 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.4 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.12 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.82 
 
 
745 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>