More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1707 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1707  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  90.08 
 
 		 262 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  89.31 
 
 		 262 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18031  hypothetical protein  69.85 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  52.87 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0119  hypothetical protein  51.81 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000942476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  51.71 
 
 		 262 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  50.79 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  49.81 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01941  Tfp pilus assembly protein PilF  54.15 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  42.98 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  42.98 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  37.92 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  39.1 
 
 		 266 aa  188  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.27 
 
 		 706 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36370  predicted protein  30.15 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.08989  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35856  predicted protein  34.07 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142385  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 685 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39123  predicted protein  32.54 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288314 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.75 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1421 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  29.53 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.73 
 
 		 406 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.73 
 
 		 406 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25.93 
 
 		 706 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 878 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.53 
 
 		 581 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 617 aa  68.6  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.73 
 
 		 988 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27 
 
 		 1056 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 		 784 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.03 
 
 		 810 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 687 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 404 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 637 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.2 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.76 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 909 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.39 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 927 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  34.09 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.18 
 
 		 1022 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 306 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.18 
 
 		 1056 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.66 
 
 		 818 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.98 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 839 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.66 
 
 		 778 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 739 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.57 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 3035 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  31.93 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.88 
 
 		 629 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.82 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  25.4 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.11 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.77 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.09 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0815  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.11 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  27.46 
 
 		 1056 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.15 
 
 		 816 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  26.32 
 
 		 334 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0844  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1827 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>