More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0118 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1927 aa  3962    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.32 
 
 		 1193 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.32 
 
 		 1193 aa  503  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.58 
 
 		 1013 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  48 
 
 		 845 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  48 
 
 		 845 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 1363 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 2654 aa  363  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1965 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 870 aa  352  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 1410 aa  335  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1603 aa  333  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 969 aa  332  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 1611 aa  329  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 1578 aa  327  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 1120 aa  322  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 		 1369 aa  321  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 734 aa  318  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 1109 aa  316  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1177 aa  315  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1078 aa  306  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1433 aa  303  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1118 aa  302  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1009 aa  295  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.08 
 
 		 1391 aa  295  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 1075 aa  293  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.05 
 
 		 1763 aa  290  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  31.04 
 
 		 1179 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 1407 aa  290  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1121 aa  287  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1767 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 780 aa  286  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1767 aa  286  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1768 aa  285  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1765 aa  284  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.61 
 
 		 2213 aa  284  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 916 aa  283  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.43 
 
 		 1120 aa  283  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 785 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1255 aa  283  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1027 aa  283  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 1767 aa  283  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1309 aa  282  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 957 aa  282  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  30.97 
 
 		 1765 aa  282  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 801 aa  281  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1226 aa  281  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 1771 aa  280  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 762 aa  279  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 1596 aa  279  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 1782 aa  278  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1195 aa  278  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 882 aa  278  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1784 aa  278  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 1064 aa  277  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1786 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1313 aa  276  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 1792 aa  276  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 765 aa  275  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1131 aa  273  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 1714 aa  273  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 984 aa  273  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 		 1303 aa  273  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 		 1070 aa  271  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 738 aa  271  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 1044 aa  271  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1271 aa  271  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 674 aa  270  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 1068 aa  270  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 1287 aa  270  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  32.06 
 
 		 1135 aa  269  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1069 aa  269  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 1266 aa  268  5.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 1203 aa  268  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 		 947 aa  268  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  30.33 
 
 		 901 aa  268  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.95 
 
 		 982 aa  268  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 		 1058 aa  267  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1222 aa  267  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1271 aa  268  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 		 989 aa  267  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1267 aa  267  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  28.9 
 
 		 1626 aa  267  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1116 aa  266  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 1202 aa  266  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.8 
 
 		 853 aa  266  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 911 aa  266  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 1029 aa  265  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 803 aa  265  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 939 aa  264  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.93 
 
 		 1331 aa  264  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 781 aa  264  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 1169 aa  263  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  27.65 
 
 		 1560 aa  263  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 1611 aa  263  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 741 aa  263  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1118 aa  262  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  33.07 
 
 		 1111 aa  262  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 		 1287 aa  262  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 1069 aa  261  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>