More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  45.96 
 
 
830 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  45.96 
 
 
830 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  44.99 
 
 
892 aa  757    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  96.38 
 
 
885 aa  1678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  100 
 
 
891 aa  1820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  45.7 
 
 
783 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  44.49 
 
 
892 aa  745    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.62 
 
 
717 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.21 
 
 
1186 aa  230  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.19 
 
 
722 aa  225  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.83 
 
 
669 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.9 
 
 
743 aa  220  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.4 
 
 
734 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  26.33 
 
 
778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.01 
 
 
778 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.06 
 
 
783 aa  194  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.16 
 
 
779 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
823 aa  184  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.5 
 
 
685 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  25.48 
 
 
753 aa  171  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.19 
 
 
862 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.06 
 
 
676 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 
728 aa  154  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.48 
 
 
681 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.81 
 
 
867 aa  147  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.67 
 
 
862 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.41 
 
 
859 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.45 
 
 
862 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 
747 aa  144  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.59 
 
 
704 aa  144  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  25.43 
 
 
757 aa  140  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.46 
 
 
661 aa  138  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.65 
 
 
688 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.05 
 
 
696 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.72 
 
 
696 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.88 
 
 
696 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.18 
 
 
660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.18 
 
 
660 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.71 
 
 
695 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.55 
 
 
861 aa  131  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  28.32 
 
 
930 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  25.7 
 
 
857 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.89 
 
 
696 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
973 aa  128  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.89 
 
 
696 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  29.61 
 
 
989 aa  125  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.37 
 
 
759 aa  124  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  23.18 
 
 
697 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
982 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  23.37 
 
 
784 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
1018 aa  119  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  21.42 
 
 
755 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  24.19 
 
 
851 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.55 
 
 
690 aa  115  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.63 
 
 
694 aa  111  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  22.83 
 
 
676 aa  111  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  22.83 
 
 
676 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.83 
 
 
676 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
1045 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.44 
 
 
677 aa  108  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.91 
 
 
657 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  25.74 
 
 
764 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.27 
 
 
689 aa  100  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  25.53 
 
 
764 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 
1040 aa  98.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.01 
 
 
697 aa  98.2  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
817 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  23.47 
 
 
652 aa  96.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
808 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  31.03 
 
 
851 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 
808 aa  92  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
791 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.28 
 
 
750 aa  90.5  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.45 
 
 
716 aa  89  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.61 
 
 
686 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.51 
 
 
762 aa  88.6  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 
778 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
1054 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  28.24 
 
 
712 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.04 
 
 
849 aa  81.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  22.79 
 
 
490 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  23 
 
 
687 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  22.29 
 
 
800 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 
667 aa  80.1  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  31.55 
 
 
693 aa  79.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  30.91 
 
 
915 aa  78.2  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 
803 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
649 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 
829 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  23.08 
 
 
668 aa  75.5  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 
668 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  30.11 
 
 
771 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 
797 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 
778 aa  73.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 
743 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 
819 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  30 
 
 
698 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
802 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
779 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>