More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  66.63 
 
 		 914 aa  1189    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  93.9 
 
 		 918 aa  1647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  100 
 
 		 918 aa  1828    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  56.61 
 
 		 914 aa  956    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 925 aa  350  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1260 aa  333  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  38.77 
 
 		 1014 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 782 aa  326  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  35.75 
 
 		 795 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  39.85 
 
 		 1322 aa  325  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 921 aa  325  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 928 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1363 aa  320  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 802 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 		 833 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 1202 aa  318  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 668 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  34.27 
 
 		 677 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.79 
 
 		 1177 aa  313  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1767 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  30.57 
 
 		 942 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  39.73 
 
 		 1135 aa  311  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  30.91 
 
 		 962 aa  311  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1767 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1767 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1765 aa  310  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.67 
 
 		 1763 aa  310  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 663 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 1397 aa  308  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  39.23 
 
 		 925 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  31.27 
 
 		 955 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 662 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.6 
 
 		 1765 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 957 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 		 1240 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 662 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1040 aa  305  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  38.96 
 
 		 925 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 993 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 1284 aa  304  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1582 aa  303  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  41.05 
 
 		 905 aa  303  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 752 aa  303  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 		 1266 aa  301  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 745 aa  300  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1310 aa  299  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2375  histidine kinase  37.36 
 
 		 806 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.824997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.12 
 
 		 1109 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1768 aa  298  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1398 aa  297  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.45 
 
 		 2213 aa  297  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 916 aa  297  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 928 aa  297  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 985 aa  297  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1784 aa  297  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  30.69 
 
 		 940 aa  297  7e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 1267 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 		 929 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  36.72 
 
 		 783 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.01 
 
 		 796 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1550 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 922 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 923 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 758 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1258 aa  296  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 923 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 1054 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 923 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 770 aa  296  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 866 aa  295  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1055 aa  295  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 1782 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 923 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1792 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  34.81 
 
 		 933 aa  292  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 2654 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  38.51 
 
 		 917 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.68 
 
 		 1346 aa  291  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1316 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 977 aa  290  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1786 aa  290  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  33.62 
 
 		 1390 aa  290  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.64 
 
 		 852 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.44 
 
 		 923 aa  290  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.79 
 
 		 1407 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 649 aa  290  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 801 aa  290  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  40.73 
 
 		 590 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  28.62 
 
 		 929 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1251 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  40 
 
 		 785 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.62 
 
 		 917 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  39.77 
 
 		 785 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 920 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  35.17 
 
 		 1188 aa  288  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1166 aa  288  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 636 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>