More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0153 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  100 
 
 		 166 aa  333  9e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  40.24 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  38.92 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  39.76 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  39.26 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  38.36 
 
 		 519 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  35 
 
 		 204 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  32.68 
 
 		 203 aa  99  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  35.93 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  33.33 
 
 		 195 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  36.75 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  36.75 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  34.57 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  37.2 
 
 		 169 aa  94.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  34.36 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  36.75 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  41.55 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  36.14 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  35.22 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  36.84 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  36.2 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  38.1 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  34.36 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  37.43 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  36.2 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  43.48 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  36.14 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  36.2 
 
 		 178 aa  91.3  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  30.91 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  34.16 
 
 		 167 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  33.94 
 
 		 189 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  34.73 
 
 		 176 aa  90.9  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  34.97 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  36.42 
 
 		 171 aa  90.9  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  39.13 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  36.71 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  33.54 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  34.71 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  34.57 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  36.69 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  32.1 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  32.93 
 
 		 184 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  32.73 
 
 		 539 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  40.34 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  36.75 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  36.69 
 
 		 174 aa  87.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  35.37 
 
 		 182 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  34.94 
 
 		 180 aa  87.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  34.91 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  34.91 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  34.71 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  34.71 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  31.58 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  31.85 
 
 		 167 aa  87.4  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  33.54 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  34.94 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1534  Shikimate kinase  36.62 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  34.16 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  35.44 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  35.19 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  32.32 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  34.59 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  31.21 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  33.53 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  32.73 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  39.5 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  37.89 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  37.89 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  33.99 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  36.6 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  32.58 
 
 		 188 aa  84.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  35.8 
 
 		 219 aa  84.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  36.2 
 
 		 177 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  38.26 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  33.33 
 
 		 173 aa  84  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  31.74 
 
 		 165 aa  84  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  31.71 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  32.54 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  32.69 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  34.32 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  35.8 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  37.65 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  33.13 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  34.21 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1596  shikimate kinase  33.8 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  36.05 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1629  shikimate kinase  33.8 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.682402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  36.91 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  32.34 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  35.5 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  32.52 
 
 		 462 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  31.48 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  31.74 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  31.74 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0225  Shikimate kinase  34.55 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.737302  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  33.73 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  33.33 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  33.77 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  35.19 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>