More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0342 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  32.2 
 
 		 483 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  29.58 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 478 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  32.88 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  33.21 
 
 		 299 aa  99  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  28.91 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  31.84 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 354 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 379 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  29.96 
 
 		 363 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 354 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 380 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 359 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.28 
 
 		 361 aa  93.2  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  30 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 339 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  32.46 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  32.74 
 
 		 409 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  29.91 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.42 
 
 		 338 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  31 
 
 		 318 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 345 aa  89.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.42 
 
 		 338 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.42 
 
 		 338 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 337 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.51 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 354 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  34.25 
 
 		 361 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 339 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  32.1 
 
 		 377 aa  86.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.5 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  27.71 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.8 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  28.92 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3326  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.92 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.88 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.92 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  30.32 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 682 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 682 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  29.44 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  30 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.03 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.22 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.23 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.34 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.73 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  30.18 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.86 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.23 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.23 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.23 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  25.77 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.23 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.23 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  27.23 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  25.11 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  26.59 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.23 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  26 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 723 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  29.47 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 383 aa  72  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  25.91 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>