More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5932 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  76.67 
 
 		 220 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 247 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 240 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 242 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 262 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 238 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 228 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 249 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.96 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30.96 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 255 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 238 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 312 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 262 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 262 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  29.35 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  34.5 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.08 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  30.69 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>