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for query gene Mpal_0232 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 380 aa  728    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  37.01 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  28.31 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  30 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  28.15 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  24.91 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  23.16 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  24.32 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  23.08 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  33.85 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 483 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  32.63 
 
 		 515 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.16 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.43 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.65 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.71 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.23 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  29.25 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  25.43 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.79 
 
 		 1062 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  28.26 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 621 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  34.3 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.86 
 
 		 504 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.71 
 
 		 680 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  25.35 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.15 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.83 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  26.2 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.54 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4004  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.01 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  25.18 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.85 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.96 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
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NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.15 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.15 
 
 		 697 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.73 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
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NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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