More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6182 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  81.21 
 
 		 818 aa  1246    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1056 aa  2100    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  69.04 
 
 		 1022 aa  1359    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  81.75 
 
 		 784 aa  1197    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  84.17 
 
 		 988 aa  1587    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  63.53 
 
 		 1056 aa  1259    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 927 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 878 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 1276 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.02 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.38 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.01 
 
 		 1694 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 		 649 aa  330  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 605 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  47.04 
 
 		 392 aa  328  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1676 aa  307  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 1421 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 4079 aa  300  6e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 		 617 aa  291  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.53 
 
 		 462 aa  291  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.68 
 
 		 1737 aa  286  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1049 aa  279  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1138 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.63 
 
 		 778 aa  270  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 543 aa  269  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 847 aa  262  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  52.92 
 
 		 713 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 562 aa  253  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  55.46 
 
 		 495 aa  251  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.18 
 
 		 706 aa  249  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  52.63 
 
 		 718 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  36.34 
 
 		 706 aa  248  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.06 
 
 		 2240 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.39 
 
 		 479 aa  245  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  54.11 
 
 		 619 aa  245  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 556 aa  245  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 602 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.46 
 
 		 708 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 450 aa  241  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.88 
 
 		 839 aa  237  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  44.81 
 
 		 750 aa  233  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 750 aa  231  6e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.95 
 
 		 1040 aa  230  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.32 
 
 		 1979 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.24 
 
 		 1056 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 804 aa  222  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.08 
 
 		 887 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.43 
 
 		 632 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 361 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.69 
 
 		 576 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1069 aa  213  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.24 
 
 		 738 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 1154 aa  208  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.95 
 
 		 2145 aa  208  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 3172 aa  207  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 425 aa  207  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 687 aa  206  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.98 
 
 		 746 aa  203  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 		 1486 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1371 aa  197  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.7 
 
 		 542 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.17 
 
 		 573 aa  195  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 4489 aa  195  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.64 
 
 		 564 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 3145 aa  193  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 306 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  43.59 
 
 		 820 aa  192  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  37.72 
 
 		 582 aa  191  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 591 aa  190  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 955 aa  189  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 3301 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 486 aa  188  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 371 aa  187  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 543 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.23 
 
 		 733 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.07 
 
 		 782 aa  186  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 		 689 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 784 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 1094 aa  184  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.55 
 
 		 936 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1054 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 935 aa  181  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 331 aa  181  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 758 aa  181  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 284 aa  181  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  37.69 
 
 		 334 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.33 
 
 		 1013 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.12 
 
 		 357 aa  178  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 566 aa  178  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  38.38 
 
 		 581 aa  177  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.06 
 
 		 373 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.55 
 
 		 490 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 366 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 409 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 409 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 634 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.62 
 
 		 1067 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 391 aa  171  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1827 aa  171  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>