More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2951 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
784 aa  1551  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  82.41 
 
 
988 aa  1194  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  81.75 
 
 
1056 aa  1198  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  91.93 
 
 
818 aa  1413  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  73.61 
 
 
1022 aa  1094  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  63.87 
 
 
1056 aa  989  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.75 
 
 
629 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.88 
 
 
878 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.87 
 
 
810 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  49.58 
 
 
392 aa  329  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
649 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 
605 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.86 
 
 
462 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
1276 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 
927 aa  291  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
617 aa  278  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
1421 aa  274  5e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  56.22 
 
 
839 aa  273  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  38.89 
 
 
706 aa  264  5e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
543 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 
1694 aa  255  2e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  57.58 
 
 
619 aa  254  5e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  37.83 
 
 
706 aa  253  8e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  58.33 
 
 
495 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  55.07 
 
 
718 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  52.67 
 
 
713 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.46 
 
 
479 aa  247  5e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 
594 aa  241  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.94 
 
 
778 aa  240  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
556 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.05 
 
 
632 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.26 
 
 
708 aa  236  1e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
1737 aa  236  2e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 
562 aa  234  4e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.71 
 
 
738 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.46 
 
 
746 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
847 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  44.85 
 
 
750 aa  221  4e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 
4079 aa  220  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
450 aa  216  1e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.31 
 
 
1676 aa  215  3e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
361 aa  214  5e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31061e-06 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 
576 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
425 aa  206  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.62 
 
 
542 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
371 aa  203  1e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
602 aa  202  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
1049 aa  201  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 
331 aa  198  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  42.29 
 
 
582 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
4489 aa  196  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  41.34 
 
 
306 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.82 
 
 
373 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  40.68 
 
 
581 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
687 aa  194  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
543 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.93 
 
 
887 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.34 
 
 
820 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.12 
 
 
573 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 
564 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 
1094 aa  187  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
486 aa  187  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
591 aa  186  1e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.57665e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.73 
 
 
1979 aa  184  5e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.45 
 
 
357 aa  184  5e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
566 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.97 
 
 
689 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.34 
 
 
784 aa  181  5e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
804 aa  180  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
1054 aa  180  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
3145 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
284 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.3055e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
935 aa  178  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.98 
 
 
471 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
1371 aa  177  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 
547 aa  177  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 
523 aa  176  1e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
1276 aa  177  1e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
955 aa  176  2e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.98 
 
 
725 aa  175  3e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
711 aa  174  4e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  36.62 
 
 
385 aa  174  4e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.26 
 
 
1138 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 
404 aa  174  6e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
366 aa  173  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.32 
 
 
406 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 
1040 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.55 
 
 
490 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.32 
 
 
406 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  44.68 
 
 
486 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.77 
 
 
2240 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
446 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.98 
 
 
733 aa  172  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.23 
 
 
707 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 
1056 aa  171  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
750 aa  171  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
391 aa  171  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  44.26 
 
 
477 aa  171  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
1069 aa  171  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>