More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3074 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 536 aa  1117    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  55.36 
 
 		 545 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  55.56 
 
 		 545 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  55.09 
 
 		 540 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  57.42 
 
 		 538 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  56.51 
 
 		 538 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.34 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  54.25 
 
 		 539 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  53.18 
 
 		 537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  55.91 
 
 		 527 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  55.91 
 
 		 527 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  55.91 
 
 		 527 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  52.99 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  52.99 
 
 		 536 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  51.54 
 
 		 537 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 		 527 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  54.49 
 
 		 527 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  52.59 
 
 		 536 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  52.99 
 
 		 540 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  52.02 
 
 		 535 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  54.11 
 
 		 527 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  51.16 
 
 		 519 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  49.7 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  47.85 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  40.25 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 		 525 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 519 aa  322  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  35.16 
 
 		 529 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  34.85 
 
 		 529 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  35.65 
 
 		 526 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  33.99 
 
 		 522 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  35.89 
 
 		 527 aa  295  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  35.48 
 
 		 535 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 535 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 		 518 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 535 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  32.82 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  32.2 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  33.69 
 
 		 534 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  33.69 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  31.57 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 534 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  29.59 
 
 		 516 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  30.82 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 		 532 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 		 515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.2 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 533 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 502 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 538 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 517 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.03 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 554 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 504 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 550 aa  146  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  25.47 
 
 		 514 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 524 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.9 
 
 		 554 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 503 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.05 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.72 
 
 		 513 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 527 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.78 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 521 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.18 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.23 
 
 		 541 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.33 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 495 aa  123  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 534 aa  123  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.43 
 
 		 532 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  23.96 
 
 		 509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>