More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0029 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  774    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  49.73 
 
 
394 aa  358  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  49.34 
 
 
393 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  49.08 
 
 
396 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  48.78 
 
 
387 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  47.49 
 
 
383 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  46.32 
 
 
381 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  47.23 
 
 
384 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.32 
 
 
381 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  46.32 
 
 
394 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  46.72 
 
 
395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  46.72 
 
 
395 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  45.23 
 
 
381 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  45.89 
 
 
390 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  46.93 
 
 
378 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.89 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  47.3 
 
 
381 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  43.55 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.23 
 
 
346 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  41.82 
 
 
399 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  47.33 
 
 
390 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  41.53 
 
 
376 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  42.18 
 
 
378 aa  289  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  42.59 
 
 
390 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  43.94 
 
 
394 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.79 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  40.7 
 
 
380 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  46.13 
 
 
364 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  41.78 
 
 
385 aa  279  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  42.33 
 
 
387 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  40.54 
 
 
382 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  43.78 
 
 
393 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  40.73 
 
 
395 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40 
 
 
391 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  42.19 
 
 
377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  40.43 
 
 
377 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  41.6 
 
 
391 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  40.26 
 
 
396 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  41.89 
 
 
385 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  40.27 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  38.16 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  37.92 
 
 
387 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  37.64 
 
 
389 aa  248  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  37.99 
 
 
384 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  35.88 
 
 
393 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  37.47 
 
 
378 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  38.24 
 
 
389 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  37.93 
 
 
390 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  36 
 
 
388 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  37.89 
 
 
390 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 
364 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  32.7 
 
 
377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  31.45 
 
 
377 aa  223  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  37.2 
 
 
390 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 
390 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
407 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35.37 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.75 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  32.53 
 
 
377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.24 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.24 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 
390 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 
390 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
381 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
366 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 
382 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
375 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.54 
 
 
385 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
374 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.9 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
384 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
384 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 
383 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  33.45 
 
 
379 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.8 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35 
 
 
369 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.29 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 
373 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 
403 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
387 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
377 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 
371 aa  105  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 
418 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  32.17 
 
 
348 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 
359 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>