More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0463 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1314 aa  2687    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1234 aa  439  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1236 aa  436  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 		 1188 aa  436  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1236 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1236 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1238 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1238 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1238 aa  430  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1238 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  34.7 
 
 		 1236 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  34.68 
 
 		 1200 aa  422  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1230 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1166 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.18 
 
 		 1233 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1165 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1234 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 1582 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1767 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1767 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.45 
 
 		 1765 aa  406  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 1245 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.48 
 
 		 2213 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1782 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1326 aa  399  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1236 aa  400  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1784 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1202 aa  400  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1765 aa  396  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  35.94 
 
 		 2035 aa  395  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1792 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1771 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1786 aa  393  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.05 
 
 		 1763 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1245 aa  389  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 920 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1768 aa  383  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1267 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.96 
 
 		 852 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1611 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 		 1331 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.54 
 
 		 1683 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  32.08 
 
 		 1439 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 1340 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1303 aa  366  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1622 aa  365  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1681 aa  365  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 2654 aa  362  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1681 aa  362  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  37.68 
 
 		 1030 aa  362  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 1548 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  37.45 
 
 		 1686 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1033 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  36.19 
 
 		 1417 aa  358  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 1284 aa  355  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1369 aa  354  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 1128 aa  353  8e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1266 aa  352  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  35.32 
 
 		 1418 aa  352  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 964 aa  351  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 1021 aa  345  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1689 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 1788 aa  343  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1245 aa  342  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 833 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1009 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 1310 aa  338  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 1574 aa  337  9e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1005 aa  335  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1426 aa  335  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 816 aa  333  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1258 aa  333  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 		 1626 aa  332  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1193 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 1643 aa  329  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1069 aa  327  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 957 aa  326  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1560 aa  324  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 981 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1374 aa  321  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 		 1333 aa  320  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1240 aa  320  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1333 aa  320  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1625 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.1 
 
 		 1135 aa  318  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  39.06 
 
 		 940 aa  315  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  31.27 
 
 		 1353 aa  314  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 812 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1691 aa  313  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 1087 aa  311  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.42 
 
 		 1442 aa  311  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 1550 aa  311  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 1275 aa  310  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1193 aa  310  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1193 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  39.22 
 
 		 1287 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  37.31 
 
 		 955 aa  308  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 1313 aa  306  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1397 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>