More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0090 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0090  shikimate kinase  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89424  predicted protein  47.37 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0316904  decreased coverage  0.0000995998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  30.51 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  30.51 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3110  shikimate kinase  34.57 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  30 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1377  Shikimate kinase  32.34 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.149071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  32.4 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  30.95 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  29.88 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  26.78 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  29.61 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  30.05 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  26.14 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  32.61 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  28.81 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  30.54 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  31.28 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  28.89 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  32.72 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  26.14 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  32.04 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  28.73 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  31.69 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  31.14 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  28.74 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  30.29 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  30.22 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  31.14 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  30.3 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  33.75 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  32.53 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1639  shikimate kinase  31.58 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00313687  normal  0.0402231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  26.37 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0660  shikimate kinase  28.57 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.737166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  30.34 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  30.39 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1388  Shikimate kinase  30.41 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00592582  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  25.75 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  29.24 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  34.38 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  29.28 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  28.18 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  29.19 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  34.38 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  26.44 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  29.09 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  28.99 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0372  shikimate kinase  31.52 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0374428  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  27.12 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  28.8 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  27.91 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  30.51 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  30.17 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  29.65 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  25.15 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  27.27 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  29.83 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  29.83 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  31.68 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  32.93 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  26.67 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  28.73 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  29.09 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  32.22 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  29.28 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  28.02 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  29.27 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  27.12 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  29.21 
 
 		 173 aa  62  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  29.44 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  27.32 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  26.26 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  29.95 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3097  shikimate kinase  29.32 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0694  shikimate kinase  26.63 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00295001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0694  shikimate kinase  26.63 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.233345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  27.62 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  27.81 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  27.62 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  27.27 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0679  shikimate kinase  30.91 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  28.75 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  24.87 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  28.74 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  27.81 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  29.55 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  29.52 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  27.27 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  27.27 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  30.95 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  31.43 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>