More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_89424 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009370  OSTLU_89424  predicted protein  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0316904  decreased coverage  0.0000995998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0090  shikimate kinase  47.37 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3110  shikimate kinase  34.87 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  35.98 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  35.8 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  34.64 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  35.2 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89141  predicted protein  29.49 
 
 		 1571 aa  72.4  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  34.32 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  33.52 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  34.12 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  33.52 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  33.53 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  30.64 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  31.52 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  34.3 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  28.31 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  32.95 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  31.93 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  29.44 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  34.76 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  30.18 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  33.13 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  32.14 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  34.09 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  30.18 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  25.26 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5129  shikimate kinase  32.14 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  30.91 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  30.91 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  28.64 
 
 		 593 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  30.95 
 
 		 169 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  34.52 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  28.89 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  31.01 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  32 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  30.95 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  32.1 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  35 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  29.41 
 
 		 1611 aa  60.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 577 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  31.06 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2010  Shikimate kinase  32.3 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269674 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  32 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  29.07 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1410  Shikimate kinase  29.88 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  28.48 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  27.75 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  30.38 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  29.09 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  29.3 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1388  Shikimate kinase  31.32 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00592582  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  32.32 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  31.29 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  29.88 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  32.1 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  29.34 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  30.72 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  31.65 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  29.27 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  32.48 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  27.75 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  30.05 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0444  shikimate kinase II  28.07 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.647174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  28.99 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  29.38 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  30.86 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  30.91 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  29.27 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0426  shikimate kinase II  27.49 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  0.531253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  31.21 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  24.85 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0431  shikimate kinase II  28.07 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0486  shikimate kinase II  28.07 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  29.49 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  30.81 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0425  shikimate kinase II  28.07 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  28.65 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  30.95 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  28.99 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  31.16 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  29.01 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  32.57 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  31.14 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  27.13 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  32.35 
 
 		 462 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  27.54 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  28.05 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  29.41 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2426  shikimate kinase  26.25 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00106596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  28.8 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  30.72 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  34.73 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1162  shikimate kinase / chorismate mutase  25.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2605  shikimate 5-dehydrogenase  33.14 
 
 		 457 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  28.48 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  29.45 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  23.67 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  34.81 
 
 		 532 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  28.82 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>