More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0988 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  92.99 
 
 		 215 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  92.56 
 
 		 215 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  75.83 
 
 		 213 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  56.87 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  45.28 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  41.78 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  36.16 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  36.15 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  36.07 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  35 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  35.65 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  34.58 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  37.26 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  36.62 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  32.69 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  35.91 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  33.49 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  36.45 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  31.28 
 
 		 332 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  31.72 
 
 		 333 aa  95.5  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  30.84 
 
 		 330 aa  92.4  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  30.4 
 
 		 330 aa  92  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  33.92 
 
 		 358 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  29.2 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  30.74 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  28.28 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  28.15 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  26.32 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.57 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  27.85 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  25 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  31.12 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  29.39 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  27.23 
 
 		 324 aa  68.2  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  26.48 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  29.96 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  27.12 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  27.12 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  27.48 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  28.36 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl206  recombinase A  26.78 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  26.57 
 
 		 337 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  26.57 
 
 		 337 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  24.6 
 
 		 344 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  26.13 
 
 		 329 aa  62  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  24.32 
 
 		 364 aa  61.6  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  25.7 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  25.96 
 
 		 337 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  25.7 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  26.09 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  23.83 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  26.25 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  23.73 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  26.06 
 
 		 428 aa  58.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  24.46 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  22.7 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  23.91 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  26.17 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  25.23 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  24.88 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  27.2 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  21.74 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  25.95 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  29.48 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  24.46 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  24.46 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  26.49 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  23.19 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  23.19 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  22.6 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  23.76 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  30.32 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  28.73 
 
 		 554 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  24.15 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  21.93 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  23.08 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  21.74 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  21.08 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  25.42 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  25.63 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  23.21 
 
 		 456 aa  55.1  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  23.67 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  21.28 
 
 		 377 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  25.59 
 
 		 379 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  22.49 
 
 		 361 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  23.08 
 
 		 355 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  22.16 
 
 		 349 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  21.93 
 
 		 348 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  24.65 
 
 		 414 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  23.19 
 
 		 341 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  23 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  25.53 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  22.97 
 
 		 790 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  23.94 
 
 		 362 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  25.81 
 
 		 458 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1372  recombinase A  22.71 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  28 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>