More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1372 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1372  recombinase A  100 
 
 		 352 aa  713    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  61.11 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  55.75 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  57.14 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  58.86 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  58.02 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  58.46 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  57.63 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  61.42 
 
 		 349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  55.19 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  58.07 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  58.33 
 
 		 349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  57.59 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  57.88 
 
 		 349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  55.19 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  58.48 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  57.4 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  57.69 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  55.13 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  57.45 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  55.36 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  56.83 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  58.39 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  56.34 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  57.14 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  57.72 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  57.01 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  56.83 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  56.34 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  55.36 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  56.27 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  58.57 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  55.86 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  62.11 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  57.19 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  57.14 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  58.07 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  57.45 
 
 		 363 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  56.79 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  58.07 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  55.69 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  57.45 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  58.91 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  57.19 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  55.86 
 
 		 383 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  56.63 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  56.7 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  56.48 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  56.79 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  54.57 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  58.64 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  55.56 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  56.53 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  56.17 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  56.17 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  56.53 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  54.94 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  55.79 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  55.86 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  58.64 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  55.86 
 
 		 376 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  56.16 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  56.29 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  55.03 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  55.03 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  55.79 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  57.76 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  54.34 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  56.31 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  58.07 
 
 		 362 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  54.73 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  55.03 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  57.1 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  54.41 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  58.6 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  55.66 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  56.43 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  56.12 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  55.9 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  55.59 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  56.56 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  60.74 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  55.56 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  53.69 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  56.07 
 
 		 366 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  56.02 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  54.83 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  55.66 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  56.79 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  56.21 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  55.25 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  56.52 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  55.9 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  56.4 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  55.66 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  56.29 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  57.54 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  55.56 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  56.44 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  55.9 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>