More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0090 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  100 
 
 		 333 aa  675    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  46.91 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  48.87 
 
 		 335 aa  315  7e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2185  recombinase A  47.22 
 
 		 350 aa  315  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019841  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  43.87 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  46.06 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  45.71 
 
 		 379 aa  309  4e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  46.5 
 
 		 358 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  42.99 
 
 		 340 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  48.4 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  45.21 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  45.57 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  45.05 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  44.34 
 
 		 376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  45.6 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  50.17 
 
 		 340 aa  305  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  45.28 
 
 		 347 aa  305  7e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  46.5 
 
 		 358 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  47.9 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2561  recombinase A  47.94 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  44.23 
 
 		 351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  47.66 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  47.52 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  44.51 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  47.92 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  45.34 
 
 		 418 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  42.37 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  47.88 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  45.28 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  45.4 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  46.71 
 
 		 364 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  43.87 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  44.01 
 
 		 346 aa  302  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  42.19 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  44.03 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  43.04 
 
 		 350 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  44.19 
 
 		 343 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  45.66 
 
 		 349 aa  301  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  44.79 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  45.22 
 
 		 358 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  43.6 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  44.69 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  44.61 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  45.22 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  43.08 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  44.66 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  42.72 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  43.04 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  44.24 
 
 		 346 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  42.24 
 
 		 365 aa  298  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  45.28 
 
 		 362 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  43.35 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  44.84 
 
 		 346 aa  298  8e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  40.99 
 
 		 378 aa  298  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  42.77 
 
 		 351 aa  298  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  42.81 
 
 		 347 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  43.55 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  43.44 
 
 		 348 aa  297  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  44.87 
 
 		 357 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  43.55 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  43.55 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  48.44 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  43.52 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  42.81 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  43.52 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  41.69 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  42.15 
 
 		 350 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  43.41 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  42.77 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  44.01 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  42.72 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  43.81 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  44.77 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  42.11 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  41.69 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  45.14 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  46.9 
 
 		 345 aa  295  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf179  recombinase A  47.24 
 
 		 334 aa  295  5e-79  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  48.24 
 
 		 361 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  45.14 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  42.39 
 
 		 352 aa  295  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  43.08 
 
 		 357 aa  295  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  43.27 
 
 		 351 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  44.44 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  44.52 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  45.96 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  44.33 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  47.57 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  43.83 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  42.77 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  44.52 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3756  recA protein  46.29 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  43.96 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  42.37 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  42.58 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  48.06 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  42.37 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  43.25 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  43.25 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  43.97 
 
 		 362 aa  292  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>