125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2384 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  99.52 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  96.19 
 
 		 210 aa  406  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  81.9 
 
 		 210 aa  359  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  56.67 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  57.35 
 
 		 208 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  56.42 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  54.76 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  52.86 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  60.48 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  52.86 
 
 		 225 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.71 
 
 		 209 aa  237  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  55.66 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  55.11 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  54.76 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  54.29 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  57.67 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  55.25 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  55.25 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  52.58 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  54.87 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  54.87 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  57.87 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  47.77 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  48.82 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  39.78 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  32.08 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  29.55 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  33.02 
 
 		 421 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  30.95 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  31.49 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  25.9 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  27.68 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  29.67 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  39.19 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.76 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  31.69 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  34.72 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  27.1 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  27.1 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  27.1 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  36.36 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  28.48 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  31.71 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  40 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  40 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.21 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.64 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  32.17 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  30.91 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  31.86 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  35.11 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  38.75 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  38.75 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  26.5 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  36.17 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  29.86 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  40 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  36.59 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  36.49 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  40.74 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  38.67 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  38.67 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  40.7 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  31.19 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  36.17 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  40 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  29.8 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  39.74 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  36.36 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.8 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  38.46 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  21.95 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  36 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  27.92 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  36.99 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  36.26 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  26.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  39.82 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  36.28 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.85 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  34.83 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  29.57 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  29.57 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  36.11 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  30.41 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  27.19 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  33.73 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.91 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  44.9 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  33.33 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  34.07 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>