More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3672 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 681 aa  1406    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 640 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 965 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 		 1291 aa  226  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.97 
 
 		 638 aa  226  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  35.86 
 
 		 901 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 839 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 		 953 aa  219  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 662 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.68 
 
 		 1207 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  59.76 
 
 		 316 aa  206  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  61.96 
 
 		 321 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  57.06 
 
 		 348 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  57.06 
 
 		 348 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  58.79 
 
 		 321 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.73 
 
 		 799 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  61.44 
 
 		 327 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 833 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  60.76 
 
 		 326 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 557 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  58.86 
 
 		 324 aa  190  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  55.97 
 
 		 318 aa  189  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  57.59 
 
 		 323 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  57.59 
 
 		 323 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  57.59 
 
 		 323 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  53.55 
 
 		 595 aa  187  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1927 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 1043 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  55.49 
 
 		 319 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  59.21 
 
 		 327 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  57.59 
 
 		 323 aa  184  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  30.8 
 
 		 694 aa  184  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  56.33 
 
 		 323 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  56.88 
 
 		 323 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  56.96 
 
 		 323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 		 807 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  53.05 
 
 		 320 aa  178  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 720 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1965 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  56.6 
 
 		 624 aa  177  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  55.06 
 
 		 322 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 492 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  32.04 
 
 		 1629 aa  173  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  52.53 
 
 		 323 aa  173  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1109 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 634 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 1060 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 1237 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  51.55 
 
 		 732 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 595 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  52.32 
 
 		 245 aa  171  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 1026 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 933 aa  170  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.3 
 
 		 878 aa  170  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 553 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.57 
 
 		 781 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  47.17 
 
 		 314 aa  168  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 696 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 698 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  50 
 
 		 669 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1485 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1064 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  45.51 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  53.29 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  39.24 
 
 		 589 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  51.97 
 
 		 240 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 763 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  52.56 
 
 		 276 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 1194 aa  164  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  52.56 
 
 		 267 aa  164  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.06 
 
 		 321 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  39.71 
 
 		 743 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  46.01 
 
 		 441 aa  163  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.92 
 
 		 442 aa  163  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  45.6 
 
 		 542 aa  163  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 401 aa  163  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 944 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.77 
 
 		 743 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1303 aa  161  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 928 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  50.63 
 
 		 438 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 639 aa  160  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1478 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 929 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  53.25 
 
 		 514 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 399 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  44.97 
 
 		 238 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1121 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  42.46 
 
 		 780 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 639 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.45 
 
 		 1550 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.54 
 
 		 680 aa  158  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 973 aa  158  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 969 aa  158  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 612 aa  158  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 829 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  56.67 
 
 		 153 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 641 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 592 aa  157  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>